Autovacuna se define como el medicamento biológico capaz de producir una inmunización activa protectora, elaborada u obtenida a partir de los microorganismos existentes en las lesiones infecciosas del mismo paciente al que se le aplica la vacuna, originando en él una respuesta inmunológica contra los microorganismos empleados en la elaboración de dicha Autovacuna. Un hecho diferencial de las autovacunas, frente a vacunas preparadas a partir de cepas bacterianas de colección, es que la expresión de moléculas de virulencia por los microorganismos utilizados para preparar la autovacuna es la misma que se encuentra en las cepas de bacterias que circulan en la población y producen patología. Por ello la riqueza antigénica de estos productos podría ser superior a la de las vacunas bacterianas de colección.