Las lipoproteínas también son clasificadas por su configuración electroforética de la movilidad en la alfa (α), beta (β), el pre-β, y lipoproteínas amplias-β. Esas lipoproteínas con el contenido proteínico mínimo se mueven más rápidamente mientras que las lipoproteínas con el movimiento contento de alto valor proteico más lento.

El movimiento de lipoproteínas se basa en la naturaleza de la apoproteína asociada a la lipoproteína. las lipoproteínas del α tienen el contenido de alto valor proteico. HDL son lipoproteínas del α, VLDL son lipoproteínas del pre-β, LDL son lipoproteínas del β, e LDL son lipoproteínas amplias-β.